Godziny otwarcia muzeum są zmienne, w okresie letnim-wakacyjnym od 24 lipca do 18 września Muzeum Historyczne Gdańska godziny otwarcia – od poniedziałku do niedzieli godz. 10:00-19:00.
Placówka jest nieczynne w dniu 1 listopada, w Dzień Zaduszny 2.11, w Wigilię 24.12 i Boże Narodzenie 25.12 oraz w Sylwestra 31.12.